生信资源

GenBank

www.ncbi.nlm.nih.gov

核酸序列数据库，存储DNA、RNA序列信息

ENA

www.ebi.ac.uk

European Nucleotide Archive，欧洲核酸序列档案库

DDBJ

www.ddbj.nig.ac.jp

DNA Data Bank of Japan，日本核酸数据库

UniProt

www.uniprot.org

蛋白质序列数据库，提供高质量蛋白质序列和功能信息

RefSeq

www.ncbi.nlm.nih.gov

参考序列数据库，提供非冗余的基因组和蛋白质序列

PDB

www.rcsb.org

Protein Data Bank，蛋白质结构数据库

EMDB

www.ebi.ac.uk

Electron Microscopy Data Bank，电镜结构数据库

AlphaFold Server

alphafoldserver.com

AlphaFold蛋白质结构预测数据库

SWISS-MODEL

swissmodel.expasy.org

蛋白质同源建模服务器，提供3D结构预测

Gene Ontology

geneontology.org

基因本体数据库，提供基因和蛋白质的功能注释

KEGG

www.kegg.jp

生物通路数据库，提供代谢通路和信号通路信息

Reactome

reactome.org

生物反应通路数据库，专注于信号转导和代谢过程

InterPro

www.ebi.ac.uk

蛋白质家族、域和功能位点数据库

DAVID

davidbioinformatics.nih.gov

提供一套全面的功能注释工具，帮助理解基因列表的生物学意义

STRING

string-db.org

蛋白质-蛋白质相互作用数据库

BioGRID

thebiogrid.org

生物分子相互作用数据库

IntAct

www.ebi.ac.uk

EMBL-EBI的蛋白质相互作用数据库

Ensembl

www.ensembl.org

脊椎动物基因组数据库，提供基因组注释和变异信息

UCSC Genome Browser

genome.ucsc.edu

加州大学基因组浏览器，提供基因组可视化工具

NCBI Genome

www.ncbi.nlm.nih.gov

NCBI基因组数据库，提供完整基因组序列和注释

GEO

www.ncbi.nlm.nih.gov

Gene Expression Omnibus，基因表达数据库

ArrayExpress

www.ebi.ac.uk

基因表达和转录组数据库

TCGA

www.cancer.gov

The Cancer Genome Atlas，癌症基因组图谱数据库

ClinVar

www.ncbi.nlm.nih.gov

临床变异数据库，提供遗传变异与疾病的关联信息

OMIM

omim.org

Online Mendelian Inheritance in Man，人类遗传病数据库

dbSNP

www.ncbi.nlm.nih.gov

单核苷酸多态性数据库